民國廿五年，中樞所頒各級警察機關編制綱要，於縣政府內設警佐一人，城區設警察所，所長由警佐兼任，城區以外，第一、二區署置巡官，由區員一人兼任，受縣政府指揮，辦理各該區警察事務，是為金門有警察之始。
民國二十七年，日軍設偽警察分駐所六處於沙尾、料羅、瓊林、古寧、烈嶼、後浦(金城)。四十六年四月籌劃金城、金湖兩鎮試辦戶警合一，民國四十八年-擴大金湖分駐所及金沙派出所成為警察所，並於金山、金寧、金瓊、烈嶼等鄉增設警察所各一。民國四十九年一月新建警察局舍於金城民生路，遷入辦公。五十年二月，復增設金城警察所。
基於整體治安維護與本縣特殊地理位置及未來發展趨勢等考量，民國九十七年局長柯昌良於十二月到任後，並期本局制度與臺灣省各縣、市警察局一體適用、完全接軌，以發揮組織健全功效、強化勤務運作效能，有效打擊犯罪，確保地區交通、治安之穩定，並企進警政人才、經驗之交流，減少區域歧異，有效提升行政效率及為民服務品質，責成相關同仁著手規劃推動修下本局組織編制：在不增加編制員額下，將組織架構由警察局、警察所的二級制，修正為三級制，即警察局、分局、分駐（派出）所。其中，金城分局所轄區域為金城鎮、金寧鄉、烈嶼鄉，原金城警察所改為金城派出所、金寧警察所改為金寧分駐所、烈嶼警察所改為烈嶼分駐所。
金城分局於97年12月29日正式成立。
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